Ministrstvo za visoko šolstvo znanost in tehnologijo opravlja naloge na področjih visokega šolstva, raziskovalne dejavnosti, tehnologije, meroslovja in pospeševanja informacijske družbe na področjih, ki ne sodijo v delovna področja drugih ministrstev, in usklajevanja dela na področju informacijske družbe.

Direktorat za znanost in visoko šolstvo opravlja naloge s področja visokega strokovnega in univerzitetnega izobraževanja ter raziskovalne dejavnosti.

Sektor za visoko šolstvo opravlja naloge, s katerimi zagotavlja načrtovanje, usmerjanje in financiranje dejavnosti visokega šolstva, študentskih domov in visokošolskih knjižnic. Oblikuje izhodišča in cilje politike visokega šolstva, analizira uresničevanje konkretnih ciljev, pripravlja Nacionalni program visokega šolstva, ga spremlja in vrednoti njegove učinke, pripravlja predloge zakonskih in drugih aktov, daje soglasje k razpisu za vpis in razmestitev študijskih programov, določa, izvaja in analizira integralno financiranje visokošolskih zavodov, analizira socialno-ekonomska vprašanja študentov, opravlja strokovne naloge glede vključevanja v visokošolski prostor EU. Prav tako sodeluje pri oblikovanju informacijskega sistema visokega šolstva, analizira in spremlja izvajanje financiranja, na drugi stopnji obravnava in rešuje tudi pritožbe za Ad futuro in študentske domove.

Sektor za znanost oblikuje strokovne podlage za sprejemanje političnih dokumentov na področju raziskovalne politike. Pripravlja zakonske in podzakonske predpise na področju raziskovalne dejavnosti. Vzpostavlja in izgrajuje sistem za celovito analiziranje in spremljanje stanja ter razvoja raziskovalne dejavnosti, razvija nove instrumente za izvajanje ciljev raziskovalne politike, načrtuje potrebni obseg finančnih sredstev za financiranje raziskovalne dejavnosti.

Direktorat za tehnologijo opravlja naloge s področja tehnološkega razvoja in inovativnosti. Na področju tehnološkega razvoja uveljavlja sodobne koncepte spodbujanja tehnološkega razvoja in inovativnosti. Pri tem zasleduje štiri temeljne usmeritve: horizontalne spodbude za raziskovalno razvojne projekte malih in srednje velikih podjetij, tehnološki programi na ožjih tehnoloških področjih, raziskovalno razvojna infrastruktura in razvoj kadrov ter vljučevanje gospodarstva v mednarodni razvojno raziskovalni prostor.

Direktorat za informacijsko družbo skrbi za pospešen, usklajen in učinkovit razvoj informacijske družbe, ki temelji na znanju in vseživljenjskem izobraževanju, v praksi pa se odraža v prenosu znanja, informacijsko komunikacijskih tehnologij in vsebin v izobraževalne in raziskovalne ustanove, organe javne uprave in lokalne samouprave, gospodarstvo ter civilne družbe. Direktorat pri svojem delu sodeluje z različnimi organizacijami tudi na področju zakonodaje, varnosti in zasebnosti v elektronskem svetu, izobraževanju, spremljanju indikatorjev razvoja informacijske družbe, spodbujanju razvoja in lokalizacije programske opreme temelječe na odprti kodi, izvedbi znanstvenih in strokovnih srečanj, izvedbi projektov za zmanjševanje digitalnega razkoraka in drugih.

Temeljna delovna področja MVZT na področju mednarodnega sodelovanja zajemajo bilateralno in multilateralno znanstveno in tehnološko sodelovanje. Gre za predstavljanje Slovenije in sodelovanje v odborih evropske komisije, aktivno sodelovanje ministrstva v projektih 5., 6. in 7. okvirnega programa EU ter aktivnosti Slovenije na znanstveno raziskovalnem področju JV Evrope. V okviru MVZT deluje tudi Urad za UNESCO, ki o pravlja naloge, ki se nanašajo na sodelovanje Republike Slovenije z UNESCO, na uresničevanje ciljev UNESCO v Sloveniji, na sodelovanje z nacionalnimi komisijami in telesi drugih držav ter nevladnih organizacij.

Organa v sestavi ministrstva sta Urad RS za meroslovje (MIRS) in Urad RS za visoko šolstvo.

Urad RS za meroslovje vzpostavlja in vodi nacionalni meroslovni sistem Slovenije vključno s sistemom na področju izdelkov iz plemenitih kovin in postopke v okviru priznanja Republike Slovenije za poslovno odličnost. Te sisteme predstavlja v ustreznih mednarodnih organizacijah in jih razvija na mednarodno primerljiv in prepoznaven način.

Urad RS za visoko šolstvo akreditira študijske programe, evalvira visoko in višje šolstvo ter habilitira visokošolske učitelje, znanstvene delavce in visokošolske učitelje.